2019-03-09 05:20:14|已浏览:1049247次
二代测序(NGS)技术已广泛应用于临床领域,NGS让我们从单个基因角度直接上升到了所有基因整体分析的层面,极大的推动了基因组学的发展。生物信息已经成为当前生命科学研究领域必不可少的技能,在今后的生命科学研究中将发挥越来越重要的作用。
如果您是医生,您还只是往公司输送样本,从公司拿报告,做个简单的提篮子的工作,那您一定是最先被先进技术冲击的那一波人,您的研究也很难往前推 进。如果您的样本检测过程中遇到了疑问,您不掌握点生信技巧的话,您就搞不清楚为何公司分析出来的是阴性报告了,或者您对于处在灰区的数据报告该作何临床决策,是否有进一步明确结论的可能。
为此我们打算推出临床级的生物信息培训。我们将详细讲述几个重要的临床基因检测的每一步分析细节,让您不再为 NGS 数据分析所困扰,同时辅助您选择最经济有效的检测技术平台。本次生物信息培训课程,课程深入浅出,覆盖面广,具有极高的使用价值。
一、培训时间:
2019年 3月23日— 3月24日(两天),每天9:00~17:30
二、培训地点:
北京辰茂鸿翔酒店(10号线牡丹园地铁站附近)
三、培训对象:
各省市、自治区有关单位从事生命科学研究和医学临床应用的老师,学生,科研人员等。
四、主讲专家:
大地同年生物科技有限公司CIO——许雄,擅长生物信息的临床算法和工具开发,先后在武汉生命之美、北京贝瑞和康、北京聚道科技担任高级生信工程师、technical lead、高级生信算法工程师等。具有十年以上科研服务、流程开发、生信核心算法工具设计经验。在贝瑞和康工作期间开发的比对算法提速了两个数量级,其开发的CNV-seq和NIPT+产品也得到了极大的应用推广。本人在近两年陆续开发了高压缩比NGS数据压缩算法、WES/CNV-seq 遗传分析突变智能筛选、一键报告系统、算法加速等,希望生物信息领域不再只是会用别人的软件,而是具备能结合临床和科研问题理解和开发自己的核心算法工具。
五、培训内容:
1. 必要的工具介绍(Linux 基本命令行、bowtie、bwa、samtools、picard、tabix)
2. NGS 数据质控
3. NIPT 分析思路(非整倍体 z-Score、胚胎 DNA 含量计算、cffDNA 片段长度分析...)
4. NIPT 分析流程的最好的开源实现
5. CNVseq VS CMA
6. WES 在遗传病辅助诊断领域的应用
7. 突变注释(annovar 和 VEP)
8. germline 突变筛选
9. WES 在实体瘤辅助用药领域的应用
10. somatic突变筛选
11. 怎么用 WES 分析大片段 CNV
12. PCRfreeWGS还可做哪些分析(STR,线粒体,SV,HLA,..)
13. 根据表型筛选突变
14. 遗传解读
15. 数据可视化(IGV,WES wig 峰图,CNV 示意图)
16.R语言基础(R语言数据结构、函数、IO、作图)
17. 自动分析 ab1 格式一代测序结果
注:学员需自备Mac或Windows操作系统的笔记本电脑
六、培训费用:
3000 元(含两天培训费用及两天的午餐)
银行转账:
账号: 8002-0408-1302-015
账户名: 湖南大地同年生物科技有限公司
开户行: 长沙银行股份有限公司科技支行
电话: 0731-88709258
注:付款到银行帐户的,请截图发给主讲人,付款前请务必确认本次主讲人为大地同年生物科技许雄!
七、报名方法: 请微信联系主讲人许雄(微信号:xuxiong491537314)
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